Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA8P48165 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA8P48165 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA8P48165 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA8P48165 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA8P48165 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA8P48165 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA8P48165 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA8P48165 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA8P48165 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms