Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL29P47914 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL29P47914 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL29P47914 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL29P47914 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL29P47914 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL29P47914 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL29P47914 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms