Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GALR1P47211 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GALR1P47211 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GALR1P47211 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GALR1P47211 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GALR1P47211 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms