Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RANGAP1P46060 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms