Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms