Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX2P40425 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX2P40425 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX2P40425 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms