Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBRP36941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBRP36941 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms