Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL4P36578 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL4P36578 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms