Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHKAP35790 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKAP35790 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHKAP35790 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHKAP35790 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKAP35790 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKAP35790 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKAP35790 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms