Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms