Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDXP35241 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDXP35241 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDXP35241 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDXP35241 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDXP35241 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDXP35241 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDXP35241 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDXP35241 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms