Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms