Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP6P35125 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP6P35125 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP6P35125 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP6P35125 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP6P35125 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP6P35125 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP6P35125 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms