Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA13P31271 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms