Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms