Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-FP30511 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-FP30511 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-FP30511 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-FP30511 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-FP30511 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-FP30511 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-FP30511 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms