Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTGFP29279 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTGFP29279 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTGFP29279 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTGFP29279 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms