Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRMP28827 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
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