Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRBP28702 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRBP28702 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRBP28702 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRBP28702 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRBP28702 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RXRBP28702 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RXRBP28702 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRBP28702 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRBP28702 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRBP28702 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRBP28702 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRBP28702 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRBP28702 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms