Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD1P28340 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD1P28340 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD1P28340 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLD1P28340 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD1P28340 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD1P28340 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms