Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB5P28074 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB5P28074 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms