Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms