Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms