Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms