Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRM1P23921 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRM1P23921 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRM1P23921 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRM1P23921 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms