Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIG1P18858 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIG1P18858 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIG1P18858 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIG1P18858 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIG1P18858 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIG1P18858 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIG1P18858 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIG1P18858 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIG1P18858 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms