Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR1P18146 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EGR1P18146 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR1P18146 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR1P18146 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR1P18146 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR1P18146 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR1P18146 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms