Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DESP17661 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DESP17661 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DESP17661 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DESP17661 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DESP17661 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DESP17661 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DESP17661 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DESP17661 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DESP17661 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms