Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF7P17544 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF7P17544 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF7P17544 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF7P17544 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms