Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.3 ms