Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms