Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT1P13805 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms