Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT13P13646 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT13P13646 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT13P13646 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT13P13646 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT13P13646 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms