Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms