Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH1P12830 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH1P12830 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH1P12830 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH1P12830 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH1P12830 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH1P12830 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH1P12830 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms