Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRFP11831 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRFP11831 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRFP11831 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRFP11831 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRFP11831 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRFP11831 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRFP11831 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRFP11831 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms