Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMC1P11047 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMC1P11047 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms