Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms