Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms