Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR89BP0CG08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR89BP0CG08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms