Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARP1P09874 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARP1P09874 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARP1P09874 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP1P09874 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARP1P09874 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP1P09874 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP1P09874 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms