Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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