Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP3P08254 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms