Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI1P08151 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI1P08151 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms