Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOP08100 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOP08100 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOP08100 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOP08100 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOP08100 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms