Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPIND1P05546 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPIND1P05546 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms