Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCCAP05165 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCCAP05165 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCCAP05165 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms