Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms