Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms