Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EGFRP00533 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EGFRP00533 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EGFRP00533 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EGFRP00533 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EGFRP00533 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EGFRP00533 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms